贞观十一年（丁酉，公元637年）
五月壬申日，魏征上奏疏，认为：“陛下向善的志向不如从前，闻过必改的态度比往日稍有减退，谴责惩罚增多，威严怒气略微严厉。由此可知‘地位尊贵难免骄傲，财富充裕难免奢侈’，这不是空话啊。况且拿隋朝的府库、粮仓、户口、兵力的强盛，和今天相比，怎能相提并论！然而隋朝因富强而躁动不安导致危亡，我们因寡弱而清静无为得以安定；安危的道理，清清楚楚摆在眼前。从前隋朝未乱时，自认为必定不会乱；未亡时，自认为必定不会亡。所以赋税徭役无穷无尽，征战讨伐不停不休，直到灾祸临头还未醒悟。照见身形没有比静止的水更好的，借鉴失败没有比灭亡的国家更合适的。希望陛下以隋朝为鉴，去掉奢侈，奉行节俭，亲近忠臣，疏远奸佞，趁着如今天下太平，践行往日的恭敬节俭，那么尽善尽美，实在无法用言语称赞。夺取天下确实困难，守住天下却很容易，陛下能完成那困难的事，难道不能保住这容易的事吗！”
六月，右仆射虞恭公温彦博去世。温彦博长期掌管国家机要事务，凡是知道的事没有不办理的。太宗对身边大臣说：“温彦博因为忧虑国事，精神耗尽，我见他身体衰弱，已经有两年了，遗憾没能让他享受安逸，最终未能长寿！”
丁巳日，太宗亲临明德宫。
己未日，太宗下诏，荆州都督荆王李元景等二十一位亲王所担任的刺史职位，都让他们的子孙世袭。戊辰日，又任命功臣长孙无忌等十四人为刺史，也令其子孙世袭，除非有重大变故，不得罢免。己巳日，改封许王李元祥为江王。
秋季七月癸未日，天降大雨，穣水、洛水泛滥，涌入洛阳宫，毁坏官署、百姓房屋，淹死六千多人。
魏征上奏疏，认为：“《文子》说：‘同样的话有人相信，是因为信任在说话之前；同样的命令有人执行，是因为诚意在命令之外。’自从陛下治理天下以来，王道清明已经十多年了，但道德教化仍未普及，是因为对待臣下未能完全做到诚信。如今建立政事、实现治理，必定委托给君子；而事情的得失，有时却向小人询问。对待君子恭敬却疏远，对待小人轻慢却亲近；亲近就会无话不谈，疏远就会情感不通。中等智慧的人，难道没有一点小聪明！但他们的才能不足以治理国家，思虑不能长远，即使竭尽全力、忠心耿耿，也难免会有失误；更何况内心怀有奸邪的人，他们的祸患难道不深重吗！即使是君子也不能没有小过错，只要不损害正道，就可以忽略不计。既然称之为君子，又怀疑他们不诚信，这和立起笔直的木头却怀疑它的影子弯曲有什么区别呢！陛下如果能慎重选拔君子，以礼相待、信任任用他们，还担心天下治理不好吗！否则，国家危亡的日子，就难以保证了。”太宗赐亲手写的诏书褒奖说：“从前晋武帝平定吴国之后，志向骄傲懈怠，何曾身居三公之位，却不能直言劝谏，反而私下对子孙说，自夸自己明智，这是最大的不忠。得到你的劝谏，我知道自己的过错了。应当把你的奏疏放在案头，把它当作自我警戒的工具。”
乙未日，太宗的车驾返回洛阳，下诏：“洛阳宫被水毁坏的部分，稍加修缮，只要能居住就行。其余的木材，供给城中毁坏房屋的百姓。命令文武百官各自上书言事，极力指出我的过错。”壬寅日，废除明德宫和飞山的玄圃院，把它们赐给遭受水灾的百姓。
八月甲子日，太宗对身边大臣说：“上书言事的人都说我打猎太频繁；如今天下太平，军备不能忘记，我时常和身边的人在后苑打猎，没有一件事烦扰百姓，这又有什么损害呢！”魏征说：“古代的君王只怕听不到自己的过错。陛下既然让他们上书言事，就应该让他们尽情陈述。如果他们的话可取，固然对国家有益；如果不可取，也没有什么损失。”太宗说：“你说得对。”于是都慰问后打发他们回去。
侍御史马周上奏疏，认为：“夏、商、周三代以及汉朝，统治年限长的有八百年，短的也不少于四百年，实在是因为用恩德凝聚人心，人们不能忘记的缘故。从那以后的朝代，长的六十年，短的才二十多年，都是因为对百姓没有恩德，根基不牢固的缘故。陛下应当弘扬夏禹、商汤、周文王、周武王的功业，为子孙后代建立万代基业，怎么能只维持当前的局面呢！如今的户口还不到隋朝的十分之一，而服劳役的人却兄去弟归，在路上接连不断。陛下虽然下了恩诏，让他们减少劳役，但土木工程不断，百姓怎么能得到休息！所以有关部门只是下发文书，却没有实际行动。从前汉朝的文帝、景帝，恭敬节俭养护百姓，汉武帝继承了他们丰富的财富，所以能穷奢极欲却不至于天下大乱。如果汉高祖之后立即传给汉武帝，汉朝怎么能长久存在呢！另外，京城和各地制造的皇帝用车、器物以及诸王、王妃、公主的服饰，议论的人都认为不够节俭。即使早起晚睡，勤奋不懈，后代尚且会懈怠，陛下年轻时生活在民间，知道百姓的疾苦，尚且还这样，何况皇太子生长在深宫之中，不经历外界的事情，陛下百年之后，这实在是陛下应当忧虑的事。我观察自古以来，百姓忧愁怨恨，聚集起来成为盗贼，这样的国家没有不灭亡的，君主即使想后悔改正，也不能再保全国家了。所以应当在能够修缮的时候进行修缮，不能在失去之后再后悔。从前周幽王、周厉王曾经嘲笑夏桀、商纣王，隋炀帝也嘲笑北周、北齐，不能让后代嘲笑今天像今天嘲笑隋炀帝一样！贞观初年，天下饥荒，一斗米价值一匹绢，而百姓没有怨恨，是因为知道陛下忧虑挂念他们的缘故。如今连年丰收，一匹绢能换十多斛粟，而百姓却抱怨叹息，是因为知道陛下不再挂念他们，多兴办一些不急需的事务的缘故。自古以来，国家的兴亡，不在于积蓄的多少，而在于百姓的苦乐。况且用近来的事情验证，隋朝在洛口仓储存粮食，却被李密利用；东都积聚布帛，却被王世充借助；西京的府库也被我们国家使用，到现在还没有用完。积蓄固然不能没有，但关键在于百姓有剩余的力量，然后再收取，不能强行征收来资助敌人。用节俭来使百姓休息，陛下在贞观初年已经亲自践行过，在今天再这样做，本来就不难。陛下如果一定要为长远打算，不必远求上古时代，只要像贞观初年那样，天下就非常幸运了。陛下对诸王的宠爱优待，有些过于优厚了，百年之后，不能不深入思考。况且魏武帝喜爱陈思王曹植，等到魏文帝即位，就囚禁了诸王，只是没有戴上刑具罢了。这样看来，魏武帝对陈思王的喜爱，恰恰是让他受苦啊。另外，百姓之所以安定，只在于刺史、县令，如果选拔任用得当，那么陛下就可以端坐拱手，无为而治。如今朝廷只重视中央官员而轻视州县官员的选拔，刺史大多任用武人，或者是京城官员不称职才补任外官，边远地区，用人更加轻视。所以百姓没有安定，大概就是因为这个原因。”奏疏呈上后，太宗称赞了很久。对身边大臣说：“刺史，我应当亲自选拔；县令，应当下诏让五品以上的京城官员各自推荐一人。”
冬季十月癸丑日，太宗下诏，功臣贵戚去世后都陪葬在皇陵旁边。
太宗在洛阳苑打猎，有一群野猪突然从林中冲出，太宗拉弓射了四箭，射死了四头野猪。有一头野猪突然冲到面前，撞到了马镫；民部尚书唐俭跳下马与野猪搏斗，太宗拔剑斩杀了野猪，回头笑着说：“天策长史难道没见过上将杀敌吗，怎么这么害怕！”唐俭回答说：“汉高祖在马上取得天下，却不在马上治理天下；陛下凭借神武平定四方，难道还要在一头野兽身上逞雄心吗！”太宗高兴，为此停止了打猎，不久加封唐俭为光禄大夫。
安州都督吴王李恪多次外出打猎，严重损害了当地百姓的利益；侍御史柳范上奏弹劾他。丁丑日，李恪因此被免官，削减封户三百户。太宗说：“长史权万纪辅佐我的儿子，不能纠正他的过错，论罪应当处死。”柳范说：“房玄龄辅佐陛下，尚且不能阻止陛下打猎，怎么能单独怪罪权万纪呢！”太宗大怒，甩袖进入宫中。过了很久，太宗单独召见柳范，对他说：“你怎么敢当面指责我？”柳范回答说：“陛下仁慈英明，我不敢不竭尽全力直言进谏。”太宗高兴了。
十一月辛卯日，太宗亲临怀州；丙午日，返回洛阳宫。
已故荆州都督武士彟的女儿，十四岁，太宗听说她美丽，召入后宫，封为才人。
贞观十二年（戊戌，公元638年）
春季正月乙未日，礼部尚书王珪上奏：“三品以上的官员在路上遇到亲王都要下车，这不符合礼仪。”太宗说：“你们这些人如果自视高贵，轻视我的儿子们。”特进魏征说：“亲王的位次在三公之下，如今三品官员都是九卿、八座，为亲王下车，实在不恰当。”太宗说：“人的寿命难以预料，万一太子不幸去世，怎么知道诸王将来不会成为你们的君主呢！怎么能轻视他们！”魏征回答说：“自从周朝以来，都是子孙相继，不立兄弟，用来杜绝庶子的觊觎，堵塞祸乱的根源，这是治国的人应当深以为戒的。”太宗于是听从了王珪的上奏。
吏部尚书高士廉、黄门侍郎韦挺、礼部侍郎令狐德棻、中书侍郎岑文本撰写《氏族志》完成，呈给太宗。在此之前，山东的崔、卢、李、郑等家族，喜欢自夸门第声望，即使历代衰败， 如果其他家族想和他们联姻，必定要索取很多财物， 有的舍弃自己的乡里而虚假地声称是名门望族， 有的兄弟地位相同却又因妻家的地位而互相欺凌。太宗厌恶这种风气，命令高士廉等人广泛搜集天下的谱牒， 依据史书验证， 考核它们的真伪， 辨别它们的辈分， 评定它们的等级， 褒扬提拔忠诚贤能的人， 贬斥罢免奸邪叛逆的人， 分为九等。高士廉等人把黄门侍郎崔民干列为第一等。太宗说：“汉高祖和萧何、曹参、樊哙、灌婴都出身于民间平民，你们到现在还推崇敬仰他们，认为他们是英雄贤才，难道在于他们的世袭官爵吗！北齐高氏偏安山东，梁、陈两朝局促江南，虽然有人才，又有什么值得称道的呢？况且他们的子孙才能品行衰败浅薄，官爵地位下降，却还高傲地以门第自负，兜售祖先的墓地，依附富贵人家，抛弃廉洁，忘记羞耻，不知道世人为什么看重他们！如今三品以上的官员，有的凭借德行，有的凭借功勋，有的凭借文学，才达到尊贵显赫的地位。那些衰败时代的旧家族，实在不值得羡慕！却要寻求和他们联姻，即使多送金银布帛，还是被他们轻视，我不明白这是什么道理！如今想要纠正错误，舍弃虚名追求实际，而你们还把崔民干列为第一等，这是轻视我的官爵而顺从世俗的人情啊。”于是下令重新修订，专门以当今的官阶品级作为高低等级。于是把皇族列为第一等，外戚列为第二等，把崔民干降为第三等。总共二百九十三姓，一千六百五十一家，颁布天下。
二月乙卯日，太宗的车驾向西返回长安；癸亥日，亲临河北，观看砥柱山。
甲子日，巫州的獠人反叛，夔州都督齐善行打败了他们，俘获男女三千多人。
乙丑日，太宗祭祀禹庙。丁卯日，到达柳谷，观看盐池。庚午日，到达蒲州，刺史赵元楷督促百姓穿着黄纱单衣迎接车驾，大肆装饰官署和楼台亭阁，又饲养了一百多头羊、几百条鱼来馈赠皇亲国戚。太宗责备他说：“我巡视黄河、洛水一带，凡是需要的东西，都由国库供应。你所做的都是隋朝灭亡的坏风气。”甲戌日，亲临长春宫。
戊寅日，太宗下诏说：“隋朝已故鹰击郎将尧君素，虽然像桀的狗对着尧狂吠一样，违背了倒戈投降的志向，但在危急关头坚贞不屈，实在表现出了寒冬中松柏的品格；可以追赠他为蒲州刺史，并且寻访他的子孙上报朝廷。”
闰二月庚辰朔日，发生日食。
丁未日，太宗的车驾到达京城长安。
三月辛亥日，着作佐郎邓世隆上表请求搜集太宗的文章。太宗说：“我的言辞命令，对百姓有益的，史书都会记载，足以不朽。如果对百姓无益，搜集它们有什么用！梁武帝父子、陈后主、隋炀帝都有文集流传于世，对他们的灭亡有什么帮助呢！作为君主，担心的是没有德政，文章有什么用！”于是没有同意。
丙子日，因为皇孙出生，太宗在东宫宴请五品以上的官员。太宗说：“贞观之前，跟随我经营天下，是房玄龄的功劳。贞观以来，纠正我的过错，是魏征的功劳。”于是都赏赐他们佩刀。太宗对魏征说：“我如今的政事和往年相比怎么样？”魏征回答说：“陛下的威望和德行所达到的地方，比贞观初年远多了；但百姓的心悦诚服却不如从前。”太宗说：“远方的人畏惧威望、仰慕德行，所以前来归顺；如果不如从前，怎么能做到这一点呢？”魏征回答说：“陛下过去因为天下没有治理好而忧虑，所以德义每天都有新的提升；如今因为天下已经治理好而安逸，所以不如从前。”太宗说：“我如今做的事情，和往年一样，怎么会有不同呢？”魏征回答说：“陛下贞观初年，担心有人不进谏，常常引导他们说话，中间阶段乐于听从他们的意见。如今却不是这样，虽然勉强听从，还是有为难的神色。这就是不同之处。”太宗说：“具体的事情可以说给我听听吗？”魏征回答说：“陛下过去想杀元律师，孙伏伽认为依法不应当处死，陛下赏赐给他兰陵公主的园林，价值一百万钱。有人说：‘赏赐太丰厚了。’陛下说：‘我即位以来，没有进谏的人，所以赏赐他。’这是引导他们进谏。司户柳雄虚假地申报隋朝的官资，陛下想杀他，采纳了戴胄的劝谏才停止。这是乐于听从意见。最近皇甫德参上书劝谏修建洛阳宫，陛下怨恨他，虽然因为我的话而停止了，却是勉强听从。”太宗说：“除了你，没有人能做到这一点。人苦于不能自知啊！”
夏季五月壬申日，弘文馆学士永兴文懿公虞世南去世，太宗哭得十分悲痛。虞世南外表温和柔顺，内心忠诚正直，太宗曾称赞他有五绝：一是德行，二是忠直，三是博学，四是文辞，五是书法。
秋季七月癸酉日，任命吏部尚书高士廉为右仆射。
乙亥日，吐蕃侵犯弘州。
八月，霸州山獠反叛，烧毁房屋、杀害刺史向邵陵及官吏百姓一百多家。
起初，太宗派遣使者冯德遐安抚慰问吐蕃，吐蕃听说突厥、吐谷浑都娶了唐朝公主，便派使者跟随冯德遐入朝，携带大量金银财宝，上表请求通婚；太宗没有同意。使者返回后，对赞普弃宗弄赞说：“我刚到唐朝时，唐朝对我十分优厚，答应嫁公主给你。恰逢吐谷浑王入朝，从中挑拨离间，唐朝的礼遇便冷淡下来，也不再答应通婚。”弄赞于是出兵攻打吐谷浑。吐谷浑抵挡不住，逃到青海以北，百姓和牲畜大多被吐蕃劫掠。
吐蕃进而击败党项、白兰等羌族部落，率领二十多万大军驻扎在松州西境，派使者进献金银布帛，声称前来迎接公主。不久后进攻松州，击败都督韩威；羌族首领阎州刺史别丛卧施、诺州刺史把利步利都献出本州反叛，归附吐蕃。战事接连不断，吐蕃大臣劝谏弄赞，他不听从，先后有八人上吊自杀。壬寅日，任命吏部尚书侯君集为当弥道行军大总管，甲辰日，任命右领军大将军执失思力为白兰道、左武卫将军牛进达为阔水道、左领军将军刘简为洮河道行军总管，统领步兵骑兵五万人攻打吐蕃。
吐蕃攻城十多天，牛进达担任先锋，九月辛亥日，趁吐蕃不备发动突袭，在松州城下击败吐蕃，斩杀一千多人。弄赞畏惧，率军撤退，派使者谢罪，同时再次请求通婚；太宗同意了。
甲寅日，太宗问侍从大臣：“帝王创业和守成哪个更难？”房玄龄说：“天下混乱之初，与各路群雄并起争夺天下，然后使他们臣服，创业艰难啊。”魏征说：“自古以来的帝王，没有不是在艰难中取得天下，在安逸中失去天下的，守成艰难啊。”太宗说：“玄龄和我一起夺取天下，出生入死，九死一生，所以知道创业的艰难。魏征和我一起安定天下，常常担心在富贵中滋生骄奢，在疏忽中引发祸乱，所以知道守成的艰难。但创业的艰难，已经过去了；守成的艰难，正应当和各位谨慎对待。”房玄龄等人跪拜说：“陛下能说这番话，是天下的福气啊。”
起初，突厥颉利可汗灭亡后，北方地区空虚，薛延陀真珠可汗率领部落在都尉犍山以北、独逻水以南建立王庭，拥有二十万精兵，立他的两个儿子拔酌、颉利苾分别主管南、北部。太宗因薛延陀强盛，担心日后难以控制，癸亥日，册封他的两个儿子都为小可汗，各赐鼓和大旗，表面上表示优待尊崇，实际上是分割他们的势力。
冬季十月乙亥日，巴州獠人反叛。
己卯日，太宗在始平打猎；乙未日，返回京城。
钧州獠人反叛；派遣桂州都督张宝德讨伐平定叛乱。十一月丁未日，开始在玄武门设置左、右屯营飞骑，由各位将军统领。又挑选飞骑中财力雄厚、骁勇健壮、擅长骑马射箭的人，号称百骑，身穿五色袍，乘坐骏马，用虎皮做马鞍垫，凡是太宗出游就跟随左右。
己巳日，明州獠人反叛；派遣交州都督李道彦讨伐平定叛乱。
十二月辛巳日，左武候将军上官怀仁在壁州攻打反叛的獠人，大败他们，俘获男女一万多人。
这一年，任命给事中马周为中书舍人。马周机智善辩，中书侍郎岑文本常常称赞：“马君议论事情，引用事例，品评古今，抓住要点、删除繁杂，文辞贴切、道理透彻，一字不能增，也不能减，听他说话娓娓动听，让人忘记疲倦。”
霍王元轨喜爱读书，恭敬谨慎、坚守本分，言行举止不鲁莽。担任徐州刺史时，与处士刘玄平结为平民之交。有人问刘玄平霍王的长处，刘玄平说：“没有长处。”提问的人感到奇怪。刘玄平说：“人有短处才能显现出长处，至于霍王，没有短处，我怎么能称赞他的长处呢！”
起初，西突厥咥利失可汗把他的国家分为十部，每部有一位酋长，还各赐一支箭，称为十箭。又分为左、右两厢，左厢号称五咄陆，设置五大啜，居住在碎叶以东；右厢号称五弩失毕，设置五大俟斤，居住在碎叶以西；统称十姓。咥利失失去民心，被他的大臣统吐屯袭击。咥利失兵败，与他的弟弟步利设逃到焉耆自保。统吐屯等人准备拥立欲谷设为大可汗，恰逢统吐屯被人杀死，欲谷设的军队也战败，咥利失重新收复了原来的土地。到这时，西部最终拥立欲谷设为乙毗咄陆可汗。乙毗咄陆即位后，与咥利失展开大战，伤亡惨重。于是两国平分西突厥的土地，自伊列水以西归乙毗咄陆，以东归咥利失。
处月、处密部落与高昌一起攻占焉耆的五座城池，劫掠男女一千五百人，烧毁他们的房屋后离去。
贞观十三年（己亥，公元639年）
春季正月乙巳日，太宗车驾前往献陵祭拜；丁未日，返回宫中。
戊午日，加封左仆射房玄龄为太子少师。房玄龄自认为担任宰相十五年，儿子房遗爱娶了太宗的女儿高阳公主，女儿是韩王妃，深知功高震主的危险，上表请求解除机要职务；太宗没有同意。房玄龄坚持请求不止，太宗下诏拒绝他的上表，他才就职。太子想拜见房玄龄，设置仪仗侍卫等待他，房玄龄不敢入宫拜见，返回府邸，当时的人称赞他谦逊有礼。房玄龄认为度支部门关系到天下的利害，曾经有空缺，寻找合适的人选没有找到，于是自己兼任度支尚书。
礼部尚书永宁懿公王珪去世。王珪性情宽厚，生活十分节俭。如今，三品以上官员都建立家庙，王珪显贵已久，却只在寝室祭祀祖先。被司法部门弹劾，太宗没有追究，命令有关部门为他建立家庙，以此让他羞愧。
二月庚辰日，任命光禄大夫尉迟敬德为鄜州都督。
太宗曾经对尉迟敬德说：“有人说你谋反，为什么呢？”尉迟敬德回答说：“我谋反是事实！我跟随陛下征战四方，身经百战，如今能活下来，都是从刀箭下逃出来的。天下已经平定，却反而怀疑我谋反吗！”于是解开衣服扔在地上，露出身上的伤疤。太宗为他流下眼泪，说：“你穿上衣服，我不怀疑你，所以才告诉你，你又何必怨恨呢！”
太宗又曾经对尉迟敬德说：“我想把女儿嫁给你，怎么样？”尉迟敬德叩头谢罪说：“我的妻子虽然粗陋，但我们一起经历贫贱很久了。我虽然没有学问，但听说古人富贵了不换妻子，这不是我所希望的。”太宗于是作罢。
戊戌日，尚书省上奏：“近代挑选后宫嫔妃，有的出自微贱家族，不懂礼仪教化；有的来自受过刑罚的家庭，心怀积怨。请求从今往后，后宫及东宫的职位有空缺，都挑选出身良家、有才能德行的人补充，按照礼仪聘娶；那些没入官府的人口以及向来微贱的人，都不得补用。”太宗听从了这个建议。
太宗已经下诏让宗室大臣世袭刺史，左庶子于志宁认为古今情况不同，恐怕不是长久安定之道，上疏争辩。侍御史马周也上疏，认为：“尧、舜的父亲，还有丹朱、商均这样的儿子。倘若有孩童继承职位，万一骄横愚蠢，百姓就会遭殃，国家也会受到损害。想废除他，可他父亲的功绩还在；想保留他，可他的恶行已经显露。与其伤害现在的百姓，不如对已去世的大臣割舍恩情，这是很明显的道理。既然如此，从前所谓的爱护，反而成了伤害。我认为应当赐给他们土地、分封食邑，要是有才能德行，就根据才能授予官职，让他们既能承受皇恩，子孙也能终身享受福禄。”
恰逢司空、赵州刺史长孙无忌等人都不愿前往封国，上表坚决推辞，说：“自从承受皇恩以来，我们孤独无依，如履薄冰；宗室亲戚忧心忡忡，如同身处水火之中。回想三代的分封制度，大概是因为力量不能控制天下，所以顺势利用分封，礼乐制度，大多不是自己制定的。两汉废除诸侯、设置郡守，消除了从前的弊端，非常符合事理，如今因为我们，又有变更，恐怕会扰乱圣朝的纲纪；而且后代愚蠢不肖的继承人，或许会触犯国家法律，自取灭亡，再因为世袭的赏赐，导致家族被灭绝，实在令人怜悯。希望停止这道已经颁布的诏令，赐予我们保全性命的恩惠。”长孙无忌又通过儿媳长乐公主向太宗坚决请求，并且说：“我披荆斩棘辅佐陛下，如今天下安宁统一，为什么要把我们弃置在外州，这和流放有什么区别！”太宗说：“分割土地分封功臣，是古今通用的道理，我想让你们的后代，辅佐我的子孙，共同长久传承；而你们却又抱怨，我难道是强迫你们接受封地吗！”庚子日，下诏停止世袭刺史的制度。
高昌王麴文泰多次阻止西域各国向唐朝朝贡，伊吾原本臣服于西突厥，不久后归附唐朝，麴文泰与西突厥一起攻打伊吾。太宗下诏书严厉斥责他，征召他的大臣阿史那矩，想和他商议事情，麴文泰不派遣，派他的长史麴雍前来谢罪。颉利可汗灭亡后，留在突厥的中原人有的逃到高昌，太宗下诏让麴文泰遣返他们，麴文泰隐匿不遣。又与西突厥一起击败焉耆，焉耆向唐朝告状。太宗派遣虞部郎中李道裕前往询问情况，并且对高昌的使者说：“高昌近年来，朝贡疏忽怠慢，没有藩臣的礼节，所设置的官号，都模仿天朝，修筑城池、挖掘壕沟，准备遭受攻讨。我的使者到那里，麴文泰对他说：‘鹰在天上飞，雉在蒿草中潜伏，猫在堂上游玩，鼠在洞穴中觅食，各自得到适宜的地方，难道不能自己生存吗！’又派使者对薛延陀说：‘既然身为可汗，就和天子地位相当，为什么要拜见他的使者！’侍奉君主无礼，又挑拨邻国关系，作恶而不诛杀，怎么能劝勉善行！明年我会发兵攻打你们。”三月，薛延陀可汗派使者上奏说：“我蒙受恩德，想要报答，请发动我的部落作为军队的向导，攻打高昌。”太宗派遣民部尚书唐俭、右领军大将军执失思力携带丝绸赏赐薛延陀，与他们商议进军夺取高昌的事宜。
夏季四月戊寅日，太宗亲临九成宫。
起初，突厥突利可汗的弟弟结社率跟随突利入朝，历任中郎将。他在家中蛮横无理，怨恨突利斥责他，于是诬告突利谋反，太宗因此轻视他，很久没有给他升职。结社率暗中勾结原来的部落，聚集了四十多人，谋划趁晋王李治凌晨出宫时，打开宫门、驱散仪仗卫队，骑马冲入宫门，直扑太宗的营帐，希望能立下大功。甲申日，他裹挟突利的儿子贺逻鹘，在夜间埋伏在宫外，恰逢刮大风，晋王没有出宫，结社率担心天亮后事情败露，于是袭击行宫，越过四重帷幕，乱箭齐发，卫士死了几十人。折冲都尉孙武开等人率领众人奋力反击，过了很久，结社率才撤退，逃入御马厩，盗取二十多匹马，向北逃窜，渡过渭水，想逃回自己的部落，被追兵抓获，斩首示众，太宗赦免了贺逻鹘，将他流放到岭南。
庚寅日，派遣武候将军上官怀仁攻打巴、壁、洋、集四州反叛的獠人，平定叛乱，俘获男女六千多人。
五月，发生旱灾。甲寅日，下诏让五品以上官员上书言事。魏征上疏，认为：“陛下的志向功业，和贞观初年相比，有十条逐渐不能坚持到底。”其中一条认为：“近年来，轻易动用民力。还说：‘百姓无事就会骄逸，让他们服劳役就容易驱使。’自古以来，没有因为百姓安逸而衰败、服劳役而安定的。这恐怕不是使国家兴盛的至理名言。”太宗大加赞赏感叹，说：“已经把你的奏疏列在屏风上，早晚瞻仰，并且抄录下来交付史官。”还赏赐魏征黄金十斤、御马两匹。
六月，渝州人侯弘仁从牂柯开辟道路，经过西赵，出邕州，打通了通往交州、桂州的交通，蛮、俚族归降的有两万八千多户。
丙申日，立皇弟李元婴为滕王。
自从结社率反叛后，上书言事的人大多说突厥人留在黄河以南不便。秋季七月庚戌日，太宗下诏任命右武候大将军、化州都督、怀化郡王李思摩为乙弥泥孰俟利苾可汗，赐给他鼓和大旗；凡安置在各州的突厥及胡人，全部让他们渡过黄河，返回原来的部落，让他们世代充当藩属屏障，长久保卫边塞。突厥人都惧怕薛延陀，不肯出塞。太宗派遣司农卿郭嗣本赐给薛延陀玺书，说：“颉利战败后，他的部落都来归顺，我赦免他们过去的过错，嘉奖他们后来的善行，对待他们的高官都像我的百官一样，对待他们的部落都像我的百姓一样。中原崇尚礼义，不灭亡别人的国家，之前打败突厥，只是因为颉利一人危害百姓，实在不是贪图他们的土地、人口和牲畜，一直想重新立一位可汗，所以把投降的部落安置在黄河以南，任由他们放牧。如今户口繁衍增多，我十分高兴。既然已经答应立可汗，就不能失信。秋季中旬将派遣突厥渡过黄河，恢复他们的故国。你们薛延陀先接受册封，突厥后接受册封，后者为小，前者为大。你们在沙漠以北，突厥在沙漠以南，各自守卫疆土，安抚部落。如果有越界无故相互劫掠的，我就发兵，各自追究其罪。”薛延陀接受诏令。于是派遣李思摩率领部落在黄河以北建立王庭，太宗亲临齐政殿为他饯行，李思摩流泪，捧着酒杯祝寿说：“我们是败亡之余，本应化为尘土，陛下保全我们的性命，重新立为可汗，愿子孙万代永远侍奉陛下。”又派遣礼部尚书赵郡王李孝恭等人携带册书，前往突厥部落，在黄河边筑坛立李思摩为可汗。太宗对侍从大臣说：“中原是根基，四方夷族是枝叶；割根基来奉养枝叶，树木怎么能繁茂！我不听魏征的话，几乎陷入困境。”又任命左屯卫将军阿史那忠为左贤王，左武卫将军阿史那泥熟为右贤王。阿史那忠是苏尼失的儿子，太宗待他十分优厚，把宗室女儿嫁给她；等到出塞后，他怀念中原，见到使者就流泪请求入朝侍奉；太宗下诏允许。
八月辛未朔日，发生日食。
太宗下诏说：“身体发肤，受之父母，不敢毁伤。近来打官司的人有的自残耳目，从今以后有犯这种罪的，先鞭打四十，然后依法处置。”
冬季十月甲申日，太宗车驾返回京城。
十一月辛亥日，任命侍中杨师道为中书令。
戊辰日，任命尚书左丞刘洎为黄门侍郎、参知政事。
太宗仍然希望高昌王麴文泰悔过，再次下玺书，向他指明祸福，征召他入朝；麴文泰最终称病不来。十二月壬申日，派遣交河行军大总管、吏部尚书侯君集，副总管兼左屯卫大将军薛万均等率领军队攻打高昌。
乙亥日，立皇子李福为赵王。
己丑日，吐谷浑王诺曷钵入朝，太宗把宗室女儿封为弘化公主，嫁给她。
壬辰日，太宗在咸阳打猎，癸巳日，返回宫中。
太子李承乾常常因为打猎荒废学业，右庶子张玄素劝谏，他不听从。
这一年，全国共有三百五十八个州府，一千五百一十一个县。
太史令傅奕深入研究术数书籍，却始终不相信，生病后，不请医生、不吃药。有一位从西域来的僧人，擅长咒术，能让人立刻死去，再念咒让他复活。太宗挑选飞骑中身体强壮的人试验，都像僧人说的那样；把这件事告诉傅奕，傅奕说：“这是邪术。我听说邪不压正，请让他咒我，一定不会起作用。”太宗命令僧人咒傅奕，傅奕起初没有感觉，过了一会儿，僧人突然倒地，好像被什么东西击打，最终没有复活。又有一位婆罗门僧人，说得到了佛齿，所击之物没有坚硬不碎的。长安的男女百姓纷纷前往观看，像集市一样热闹。傅奕当时卧病在床，对他的儿子说：“我听说有金刚石，质地极其坚硬，没有东西能损伤它，只有羚羊角能击破它，你去试试。”他的儿子前往观看佛齿，拿出羚羊角敲击，佛齿立刻破碎，观看的人才散去。傅奕临终前，告诫他的儿子不要学习佛书，终年八十五岁。又搜集魏晋以来驳斥佛教的人，编写成《高识传》十卷，流传于世。
西突厥咥利失可汗的大臣俟利发与乙毗咄陆可汗合谋作乱，咥利失陷入困境，逃奔嚭购笏廊ァe笫П喜柯溆接他的侄子薄布特勒立为可汗，这就是乙毗沙钵罗叶护可汗。沙钵罗叶护即位后，在虽合水以北建立王庭，称为南庭，龟兹、鄯善、且末、吐火罗、焉耆、石、史、何、穆、康等国纷纷归附。乙毗咄陆在镞曷山西建立王庭，称为北庭，厥越失、拔悉弥、驳马、结骨、火燅、触水昆等国全部归附，以伊列水为边界。
贞观十四年（庚子，公元640年）
春季正月甲寅日，太宗亲临魏王李泰的府邸，赦免雍州长安县在押的死刑以下囚犯，免除延康里当年的租赋，赏赐李泰府中的僚属及同里的老人不等。
二月丁丑日，太宗亲临国子监，观看释奠典礼，命令祭酒孔颖达讲解《孝经》，赏赐祭酒以下直至成绩优异的学生不等的丝绸。当时太宗大规模征召天下名儒担任学官，多次亲临国子监，让他们讲论经义，学生能通晓一部儒家经典以上的都能补任官职。增建学舍一千二百间，增加学生到三千二百六十人，连屯营飞骑也配备博士，让他们教授经书，有能通晓经书的，允许参加贡举考试。于是四方学者云集京城，甚至高丽、百济、新罗、高昌、吐蕃等国的酋长也派遣子弟请求进入国学，登上讲筵听讲的有八千多人。太宗因为儒家学说的师承众多，章句繁杂，命令孔颖达与各位儒士撰写《五经》义疏，称为《正义》，让学者学习。
壬午日，太宗亲临骊山温泉；辛卯日，返回宫中。
乙未日，太宗下诏寻求近代名儒梁代皇甫侃、褚仲都，周代熊安生、沈重，陈代沈文阿、周弘正、张讥，隋代何妥、刘炫等人的子孙，上报朝廷，将加以引荐提拔。
三月，窦州道行军总管党仁弘攻打罗窦反叛的獠人，击败他们，俘获七千多人。
辛丑日，流鬼国派遣使者入朝进贡。流鬼国距离京城一万五千里，濒临北海，南邻靺鞨，从未与中原往来，通过三次翻译才来到唐朝。太宗任命其使者佘志为骑都尉。
丙辰日，设置宁朔大使，以保护突厥。
夏季五月壬寅日，改封燕王李灵夔为鲁王。
太宗将要前往洛阳，命令将作大匠阎立德寻找避暑的地方。秋季八月庚午日，在汝州西山修建襄城宫。阎立德是阎立本的哥哥。
高昌王麴文泰听说唐朝出兵，对他的国人说：“唐朝距离我们七千里，其中二千里是沙漠，土地没有水草，寒风像刀一样，热风像火烧一样，怎么能派大军前来呢！过去我入朝，见到秦、陇以北，城邑萧条，不再有隋朝时的景象。如今前来攻打我们，发兵多则粮草运输跟不上；三万以下，我们的力量就能制服他们。应当以逸待劳，坐收其弊。如果唐军在城下停留，不超过二十天，粮草耗尽必然撤退，然后我们趁机追击俘虏他们。有什么值得忧虑的！”等到听说唐军抵达沙漠口岸，他忧愁恐惧，不知所措，发病而死，儿子麴智盛即位。
唐军到达柳谷，侦察兵说麴文泰将在近日下葬，国人都聚集在那里，各位将领请求袭击他们，侯君集说：“不行，天子因为高昌无礼，所以派我讨伐他们，如今在墓地袭击别人，不是讨伐罪责的军队。”于是擂鼓进军，到达田城，劝谕他们投降，田城守军不投降，黎明时分发起进攻，到中午就攻克了，俘获男女七千多人。任命中郎将辛獠儿为前锋，夜间奔赴高昌都城，高昌出兵迎战，战败，大军随后赶到，抵达城下。
麴智盛给侯君集写信说：“得罪天子的是先王，上天的惩罚已经施加，他已经去世。我即位不久，希望尚书怜悯体察。”侯君集回信说：“如果能悔过，就应当束手到军营门前投降。”麴智盛仍然不出来。侯君集命令填埋壕沟攻城，飞石如雨般落下，城中的人都躲在房屋里。又建造巢车，高达十丈，俯瞰城中。有行人以及被飞石击中的人，都大声告知城中。起初，麴文泰与西突厥可汗结盟，约定有紧急情况相互援助；西突厥可汗派遣他的叶护驻守可汗浮图城，为麴文泰声援。等到侯君集抵达，西突厥可汗畏惧，向西逃走一千多里，叶护献出城池投降。麴智盛陷入困境，癸酉日，打开城门出城投降。侯君集分兵攻占土地，攻克二十二座城池，有八千零四十六户，一万七千七百人，土地东西八百里，南北五百里。
太宗想把高昌改为州县，魏征劝谏说：“陛下刚即位时，麴文泰夫妇首先前来朝见，后来逐渐骄横傲慢，所以才加以诛伐。罪责只在麴文泰一人，应当安抚他的百姓，保全他的国家，重新立他的儿子为可汗，那么威望和德行就能遍及边远地区，四方夷族都会心悦诚服。如今如果贪图他的土地设置州县，就需要常年派一千多人镇守，几年更换一次，往来途中死亡的人有十分之三四，供应衣物物资，远离亲戚，十年之后，陇右就会空虚耗费。陛下最终不能得到高昌的一粒粮食、一尺丝绸来资助中原，这就是所谓的分散有用的力量来做无用的事情。我看不出这样做的好处。”太宗不听从，九月，将高昌土地设为西州，将可汗浮图城设为庭州，各自设置属县，乙卯日，在交河城设置安西都护府，留下军队镇守。
侯君集俘获高昌王麴智盛及其群臣豪杰返回唐朝。于是唐朝的疆域东到大海，西到焉耆，南到林邑，北到大漠，都设置了州县，东西共计九千五百一十里，南北共计一万九百一十八里。
侯君集讨伐高昌时，派遣使者约焉耆与他合力，焉耆高兴地听从命令。等到高昌被攻破，焉耆王前往军营门前拜见侯君集，并且说焉耆的三座城池先前被高昌夺取，侯君集上奏将高昌掠夺的焉耆百姓全部归还。
冬季十月甲戌日，荆王李元景等人再次上表请求封禅，太宗没有同意。
起初，陈仓折冲都尉鲁宁因事被关押在狱中，自恃官阶高，辱骂陈仓尉尉氏人刘仁轨，刘仁轨用杖打死了他。州府上报朝廷。太宗大怒，命令处死刘仁轨，怒气仍未平息，说：“一个小小的县尉，竟敢杀我的折冲都尉！”命令将他追回长安当面责问。刘仁轨说：“鲁宁当着百姓的面这样侮辱我，我实在愤怒才杀了他。”言辞神色镇定自若。魏征在旁边侍奉，说：“陛下知道隋朝灭亡的原因吗？”太宗说：“为什么？”魏征说：“隋朝末年，百姓强悍而欺凌官吏，就像鲁宁这样。”太宗高兴，提拔刘仁轨为栎阳丞。
太宗将要前往同州打猎，刘仁轨上书说：“今年秋季大丰收，百姓收获的还只有十分之一二，让他们供应打猎事宜，修整道路、修补桥梁，动辄耗费一两万个工日，实在妨碍农业生产。希望陛下稍微停留十天，等待百姓收割完毕，这样公私都能受益。”太宗赐玺书嘉奖并采纳了他的建议，不久提拔他为新安县令。闰十月乙未日，太宗前往同州；庚戌日，返回宫中。
丙辰日，吐蕃赞普派遣他的丞相禄东赞献上五千两黄金以及数百件珍玩，请求通婚。太宗答应将文成公主嫁给她。
十一月甲子朔日，冬至，太宗在南郊祭祀。当时《戊寅历》以癸亥日为朔日，宣义郎李淳风上表说：“古代历法划分日期从子时的一半开始，今年甲子朔日冬至，但前太史令傅仁均减少余数过多，以子时初为朔日，于是相差三刻，与天体运行不符，请重新加以考定。”众人商议认为傅仁均确定的朔日略有误差，李淳风的推算校订更为精密，请求按照李淳风的建议，太宗听从了。
丁卯日，礼官上奏请求将为高祖父母的服丧期改为齐衰五月，嫡子的妻子服丧期改为一年，嫂子、小叔、弟弟的妻子、丈夫的哥哥、舅舅都服小功；太宗听从了。
丙子日，百官再次上表请求封禅，太宗下诏同意。又命令各位儒士详细制定礼仪制度；任命太常卿韦挺等人为封禅使。
司门员外郎韦元方给使者发放过所（通行凭证）拖延迟缓，使者上奏此事；太宗大怒，将韦元方贬为华阴县令。魏征劝谏说：“帝王的震怒，不能随意发作。前几天因为使者的事情，连夜发出敕书，处理得像军事机密一样，谁不震惊害怕！况且宦官这类人，自古以来就难以教养，容易说长道短，引发祸患，让他们独自远行出使，很不合适，这种风气不能助长，应当慎重对待。”太宗采纳了他的意见。
尚书左丞韦悰核查司农寺的木材价格比民间昂贵，上奏说司农寺有隐瞒吞没之罪。太宗召见大理卿孙伏伽记录司农寺的罪责。孙伏伽说：“司农寺没有罪。”太宗感到奇怪，询问原因，孙伏伽回答说：“只因为官府的木材价格贵，所以民间的木材价格才便宜。如果官府的木材价格便宜，民间的木材价格就无法便宜了。我只看到司农寺识大体，没看到他们的过错。”太宗醒悟，多次称赞孙伏伽；回头对韦悰说：“你的见识和才能远远不如孙伏伽。”
十二月丁酉日，侯君集在观德殿献上俘获的高昌君臣。太宗举行饮至礼（军队凯旋后的庆功宴），大规模宴饮三天。不久，任命麴智盛为左武卫将军、金城郡公。太宗得到高昌的乐工，将他们交付太常寺，把原来的九部乐扩充为十部乐。
侯君集攻破高昌后，私自盗取当地珍宝；将士们得知后，争相盗窃，侯君集无法禁止，被有关部门弹劾，太宗下诏将侯君集等人关进监狱。中书侍郎岑文本上疏，认为：“高昌王昏庸无道，陛下命令侯君集等人讨伐并攻克了它，不到十天，就将他们交付大理寺治罪。虽然侯君集等人自陷法网，但恐怕天下人会怀疑陛下只记录他们的过错，而遗忘他们的功劳。我听说任命将领出兵，主要目的是战胜敌人，如果能战胜敌人，即使贪婪也可赏赐；如果战败，即使廉洁也可诛杀。因此汉朝的李广利、陈汤，晋朝的王浚，隋朝的韩擒虎，都身负罪责，君主因他们有功，都给予了封赏。由此可见，将帅大臣中，廉洁谨慎的少，贪图财物的多。所以黄石公《军势》说：‘任用有智谋的人、勇敢的人、贪婪的人、愚笨的人，智谋的人乐于立功，勇敢的人喜好实现志向，贪婪的人急于求利，愚笨的人不顾生死。’希望陛下记录他们的微小功劳，宽恕他们的重大过错，让侯君集重新回到朝廷任职，继续为陛下效力，虽然他们不是清正廉洁的大臣，仍可作为能利用其贪婪和愚勇的将领，这样陛下虽然违背法律却能彰显仁德，侯君集等人虽然得到宽恕却更能彰显他们的过错。”太宗于是释放了他们。
又有人告发薛万均私通高昌妇女，薛万均不服，太宗从宫中放出高昌妇女交付大理寺，让她与薛万均对质，魏征劝谏说：“我听说‘君主以礼对待臣子，臣子以忠侍奉君主。’如今派遣大将军与亡国妇女对质闺房私情，属实的话所得的利益轻微，不实的话所失去的威严沉重。从前秦穆公赦免盗马的人，楚庄王宽恕绝缨的罪臣，何况陛下的道德高于尧、舜，却还不如这两位君主吗！”太宗立即释放了薛万均。
侯君集的马额头生疮流脓，行军总管赵元楷亲自用手指沾脓嗅闻，御史弹劾他谄媚，将他降职为括州刺史。
高昌平定后，各位将领都立即受到赏赐，行军总管阿史那社尔因没有皇帝的敕旨，唯独不接受赏赐，等到另外的敕旨下达后，才接受，所取的只是一些年老体弱的奴仆和破旧物品而已。太宗赞赏他的廉洁谨慎，把从高昌得到的宝刀和一千段各种彩色丝绸赏赐给他。
癸卯日，太宗在樊川打猎；乙巳日，返回宫中。
魏征上疏，认为：“在朝的群臣中，担任机要职务的人，虽然职责重大，但陛下对他们的信任还不够深厚，因此有人心怀疑虑，处事苟且。陛下对大事宽容，对小罪严苛，临时发怒斥责，难免掺杂个人爱憎。委托大臣处理大事，责成小臣办理小事，这是治国的道理。如今任命官职时，重视大臣而轻视小臣；等到遇到事情时，却信任小臣而怀疑大臣。信任所轻视的人，怀疑所重视的人，想要实现天下大治，怎么可能呢！如果任命大臣担任高官，却苛求他们的细小过错，那些舞文弄法的官吏，就会顺着陛下的旨意，歪曲法律，罗织罪名。大臣为自己辩解，就认为他们心中不服罪；不辩解，就认为他们所犯罪行都是事实；进退两难，无法自证清白，就会苟且谋求免祸，弄虚作假成为风气。”太宗采纳了他的意见。
太宗对侍从大臣说：“我虽然平定了天下，但守住天下却非常困难。”魏征回答说：“我听说战胜容易，守住胜利的成果困难，陛下能说出这番话，是宗庙社稷的福气啊！”
太宗听说右庶子张玄素在东宫多次劝谏太子，提拔他为银青光禄大夫，代理左庶子。太子曾经在宫中击鼓，张玄素敲门恳切劝谏；太子拿出鼓，当着张玄素的面把它毁坏。太子长时间不接见东宫官属，张玄素劝谏说：“朝廷选拔优秀贤能的人来辅佐太子，如今动辄数月不见宫中大臣，这对太子的品德修养有什么益处呢！况且宫中只有妇女，不知道有没有像樊姬那样贤德的人呢？”太子不听从。
张玄素年轻时担任刑部令史，太宗曾经在朝臣面前问他：“你在隋朝担任什么官职？”张玄素回答说：“县尉。”太宗又问：“没担任县尉时是什么官职？”回答说：“流外官（不入流的小吏）。”太宗又问：“在哪个部门？”张玄素感到羞耻，走出宫殿时几乎不能迈步，脸色像死灰一样。谏议大夫褚遂良上疏，认为：“君主能以礼对待臣子，臣子才能竭尽全力。张玄素虽然出身寒微，但陛下看重他的才能，提拔他为三品官员，辅佐皇储，怎么能再在群臣面前穷究他的出身呢！抛弃往日的恩德，造成一朝的羞耻，让他心怀郁结，又怎么能要求他坚守节操、为国捐躯呢！”太宗说：“我也后悔问了这件事，你的奏疏深深契合我的心意。”褚遂良是褚亮的儿子。孙伏伽和张玄素在隋朝都担任令史，孙伏伽有时在大庭广众之下自述往事，毫无隐瞒。
戴州刺史贾崇因为所管辖的地区有人犯了十恶之罪，被御史弹劾。太宗说：“从前唐尧、虞舜这样的大圣人，贵为天子，也不能感化他们的儿子；何况贾崇只是一个刺史，难道能让他的百姓家家户户都行善吗！如果因为这件事被贬黜，那么州县官员就会互相包庇，放纵罪犯。从今以后，各州有犯十恶之罪的，不要弹劾刺史，只让他们明确加以纠察，依法定罪，希望能肃清奸恶之人。”
太宗亲自检阅军队，因为部队阵列不整齐，命令大将军张士贵杖责中郎将等人；又因为杖责过轻而发怒，将张士贵交给司法官吏治罪。魏征劝谏说：“将军的职责，是国家的爪牙；让他执行杖责，已经不符合国家的法度，何况因为杖责过轻就将他交给司法官吏治罪呢！”太宗立即释放了张士贵。
上书言事的人大多请求太宗亲自阅览表奏，以防被蒙蔽。太宗以此询问魏征，魏征回答说：“这些人不识大体，如果一定要让陛下一一亲自阅览，不仅朝堂上的事情，州县的事情也应当亲自处理了。”
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